こんにちは、たまごはん です。
こんなド深夜にドライブするのは初めてでしたが、街が静まり返ったあの感じは堪らなく良いですね…。
特に、通勤のときにいつも通ってる道は車だらけの様子しか知らないので、車が一台も走ってないってのはめちゃくちゃ新鮮でした。
少しハマってしまいそうです…笑
また今度やろう。
Cophenetic 相関係数
こんにちは、たまごはん です。
同じ要素で構成された 2 つのデンドログラムを比較したいな、と思ってたんですが、Cophenetic 相関係数なるものがあるみたいですね。
どうやらデンドログラム上の距離行列を計算して、それらの相関係数を求めるようです。
R の dendextend や Python の SciPy に実装されてるとのことで、今度使ってみたいと思います。
それでは。
車通勤してみての感想
こんにちは、たまごはん です。
早いことに今年ももう残り 4 ヶ月となりました。
実は先月の終わり頃から車通勤をし始めました。それまではバスと電車で行き来してたんですが、1 本遅れると 30 分後の電車しかなかったり、雨の日は駅前が激混みするせいでバスの到着が数十分遅れたりして、結構大変でした。車通勤に変わってからは時刻表に悩まされることも、雨の日にわざわざ朝早くに出なくちゃいけないことも無くなったので、本当に最高ですね！
行きは山道を通るようにしてるので、毎朝がワインディングでめちゃくちゃ楽しいです。まぁ他にも車がいるので飛ばすことはできませんが…。ただ、シフトチェンジの楽しさを感じたり練習にもなるので、これからも走ると思います。
帰りは街中を通るルートを走ってます。暗い中あの山道を通るのは色んな意味で怖いし、過去に一回、夜に通ったときは虫がもうそれはそれは凄かったので、街中を走るようにしました。車の中からでも分かるぐらい大きいバッタが地面を歩いてたり、デカい蛾？みたいな虫がフロントガラスにバチっとぶつかったりして、「夜はやめとこう」とすぐに誓いました。
そんなわけで車通勤に変えて良かったよ、という話でした。今はガソリン代がネックですが、続けていきたいと思います。
それでは。
念願の納車
こんにちは、たまごはん です。
『納車』
…ﾝﾌﾌ、良い響きです。
というわけでつい先日、人生初のマイカーが納車されました。
インドア人の私にとって無縁の代物だと思ってたのに、まさか自分が車を買う日が来るなんて…と自分が一番驚いてます。数年前の自分からは考えられない進歩です。
納車当日は台風の影響で天候が荒れるかもと不安でしたが、台風なんて何のその。新しい門出に相応しいほどの快晴でした。お天道様、天晴れ。
初めての相棒はスイフトスポーツ（ZC33S）にしました。
信号で止まるたびにアイドリングストップかな？と思うくらい静かで驚いてます。あと 4 速でも坂道をグングン登っていく力強さも凄いです。
今は車をイジる知識も技術もないので改造する気なんて更々ないですが、シフトノブとかペダルくらいはそのうち交換したいですね〜。
でもまずは、街や峠や色んなところを走って絆を深めていきたいと思います。
よろしく、相棒！
ggtree で R が落ちる話
こんにちは、たまごはん です。
この前、R の ggtree で系統樹を描く機会があったんですが、その際、描こうとするたびに R がクラッシュして一向に描けないということがありました。
結論から言うと、負の長さを持つ枝が含まれていたことが原因でした。負の長さとはいっても 10-16 くらいだったので、計算誤差によるものだと思います。
そこで無理やり 0 に押さえ込んだんですが解決せず、仕方ないとネットを漁りまくったところ、ようやく解決策を見つけました。
ggtree の引数に options(ignore.negative.edge=TRUE) を入れるだけです。
2〜3 時間も R と格闘してたあの時間はなんだったのか…。
やっぱりちゃんと調べなきゃですね。それでは。
